密码子使用频率计算工具- Sequence Manipulation Suite
密码子使用频率计算工具用于统计一条或多条DNA中每一种密码子的使用次数和使用频率。因为此工具会比较同义密码子的使用频率,所以您可以用它来评估特定同义密码子的组成是否与特定物种相符。
直接输入序列或者输入FASTA格式序列,长度限定在500000以内
>sample sequence one atgtttcagaaagaggatcttgctacatggatgcaaatttcaatgagtggtcaatttgatgatacagcattagaggaatggagtacaaatggtaaagaacctgagatctgtgagaaatctccaaaagctgatggagttactacgattatggagagagctctatgtccatgggatagcagagtcaactaccaagagagccgagaacctaaattgattgctgaatcagtttgtctatgccgtaagagccgtggttctacaggagctttctgtatgccaattgttcgaaaagttccaattctccgacgtgtctcttgtgatcgttcaacaggtttatggaattatgtaagatcaactgagctaataactgttggatgtcattctgtattgccaagaactcaaagagcagcacgtcttgcccatttatcatcttctcgtattattgtttaa >sample sequence two caggttacaattggagccatttcatcttctgactgaggaaatcaggtccgacagcgtagatgtatacacgctctattcacaaaattggtaacgattctg
*使用
standard (1)
vertebrate mitochondrial (2)
yeast mitochondrial (3)
mold mitochondrial (4)
invertebrate mitochondrial (5)
ciliate nuclear (6)
echinoderm mitochondrial (9)
euplotid nuclear (10)
bacterial (11)
alternative yeast nuclear (12)
ascidian mitochondrial (13)
flatworm mitochondrial (14)
Blepharisma macronuclear (15)
chlorophycean mitochondrial (16)
trematode mitochondrial (21)
Scenedesmus obliquus mitochondrial (22)
Thraustochytrium mitochondrial (23)
密码子表
.
* 此工具需要浏览器支持JavaScript. 详情请见
浏览器兼容性介绍.
* 您可以
镜像此工具到自己的网站
or也可以单机使用