猴痘病毒最新基因測序結(jié)果公布!世衛(wèi):猴痘病毒已發(fā)生人際傳播
發(fā)布時(shí)間:2022-05-24 16:31:08來源:澎湃新聞、新華社
截至5月21日,來自葡萄牙、比利時(shí)、美國的三個(gè)研究小組分別公布了近期在全球多地暴發(fā)的猴痘(Monkeypox)疫情中感染者所攜帶病毒基因組序列的初步結(jié)果。三份猴痘病毒(MPXV)的DNA序列初步顯示同源,同屬溫和的西非株系,其與2018年和2019年在英國、新加坡和以色列發(fā)現(xiàn)的猴痘病毒關(guān)系密切。
5 月 13 日 至 21 日 WHO 收到的猴痘非流行國家病例報(bào)告。來源:WHO
此前世界衛(wèi)生組織曾表示,猴痘病毒主要有兩個(gè)分支:西非分支和剛果盆地分支。西非分支的致死率較低,大約1%的感染會(huì)導(dǎo)致死亡;剛果盆地分支則可以導(dǎo)致10%的死亡率。
當(dāng)?shù)貢r(shí)間5月19日,葡萄牙國家衛(wèi)生研究所的約翰.保羅.戈麥斯(João Paulo Gomes)及其同事在(https://virological.org)網(wǎng)站上,以論文形式公布了團(tuán)隊(duì)5月4日對(duì)一名葡萄牙男性患者攜帶的猴痘病毒的基因組測序草案(PT0001)。這也是近期全球多地暴發(fā)猴痘疫情以來,第一份猴痘病毒最新基因組的測序結(jié)果。
葡萄牙團(tuán)隊(duì)公布的基因進(jìn)化樹分析草案基于對(duì)包括52個(gè)猴痘病毒基因序列的核心比對(duì)(在137 668 bp長度的基因序列中比對(duì)了955個(gè)變異位置)
根據(jù)這篇論文,基因進(jìn)化樹分析草案顯示,分離出來的病毒與2018年和2019年從尼日利亞傳播到英國、以色列和新加坡的病毒有密切關(guān)系。
比利時(shí)的樣本報(bào)告則于當(dāng)?shù)貢r(shí)間5月20日公布。比利時(shí)安特衛(wèi)普大學(xué)的研究人員在(www.virological.org)上發(fā)布其對(duì)該國一名猴痘患者攜帶的病毒基因測序報(bào)告。
隨后,研究者在Oxford Nanopore的minION平臺(tái)上使用非靶向宏基因組學(xué)方法獲得猴痘病毒全基因組序列數(shù)據(jù),重構(gòu)了98.9%的基因組,平均測序深度為18.9倍。
圖二:比利時(shí)團(tuán)隊(duì)公布的猴痘病毒基因進(jìn)化樹
研究者稱,通過對(duì)新測序基因組與此前公開基因組的蛋白質(zhì)編碼區(qū)的核心區(qū)域進(jìn)行快速比對(duì),他們發(fā)現(xiàn),比利時(shí)猴痘病毒基因組(ITM_MPX_1)也屬于猴痘病毒的西非分支,與最近上傳的葡萄牙疫情基因組關(guān)系最為密切,這進(jìn)一步證明了在歐洲有大量的社區(qū)傳播。
第三份猴痘病毒基因組測序報(bào)告(MA001)由美國研究者公布。當(dāng)?shù)貢r(shí)間5月20日,美國的研究團(tuán)隊(duì)公布了5月18日在美國馬塞諸塞州確診的猴痘患者所攜帶病毒的基因測序結(jié)果。目前的數(shù)據(jù)結(jié)果僅公布在國家醫(yī)學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館的數(shù)據(jù)庫中,未有相關(guān)文章公開發(fā)表。
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2241461119)
世界衛(wèi)生組織表示,自5月13日以來,全球12個(gè)未流行猴痘病毒的國家已報(bào)告了92例確診病例和28例疑似病例。現(xiàn)有信息表明,與有癥狀的病例發(fā)生密切身體接觸的人群中正在發(fā)生人際傳播。
數(shù)據(jù)顯示,這些確診和疑似病例主要來自英國、西班牙和葡萄牙,其余分布在澳大利亞、比利時(shí)、加拿大、法國、德國、意大利、荷蘭、瑞典和美國。到目前為止,還沒有相關(guān)的死亡報(bào)告。
世衛(wèi)組織預(yù)計(jì),隨著監(jiān)測的擴(kuò)大,未來有可能在已報(bào)告病例的國家和其他國家發(fā)現(xiàn)更多病例。
據(jù)聯(lián)合國網(wǎng)站介紹,猴痘是一種罕見的病毒性人畜共患病(從動(dòng)物傳播給人的病毒),病人癥狀與過去在天花病人身上所觀察到的相似,但臨床嚴(yán)重程度較輕。